یک منبع آگاه در گفت‌وگو با «اعتمادآنلاین» اعلام کرد که فرهاد رهبر، رئیس دانشگاه آزاد اسلامی نسبت به دخالت‌های علی‌اکبر ولایتی رئیس هیأت امنا و رئیس هیأت موسس دانشگاه آزاد اسلامی در امور مختلف این دانشگاه معترض است و بر همین اساس تصمیم گرفته که از سمتش استعفا بدهد ولی تاکنون ولایتی با استعفای او موافقت نکرده است.
این منبع ادامه داد: هر چند ولایتی با این درخواست رهبر موافقت نکرده اما چانه‌زنی‌هایی برای انتصاب یک فرد جدید برای ریاست دانشگاه آزاد را در دستور کار خود قرار داده است و گزینه هایی هم برای این پست مطرح شده‌اند.
از جمله این گزینه‌ها می‌توان به سیدمحمد حسینی، وزیر فرهنگ و ارشاد اسلامی دولت محمود احمدی‌نژاد اشاره کرد. حسینی بیشتر از دیگر گزینه‌ها محتمل است.
فرهاد رهبر، رئیس دانشگاه آزاد اسلامی امروز از اخراج اساتید از این دانشگاه دفاع کرد و گفت: هر استادی که بخواهد خدشه‌ای به دین، قرآن و پیغمبر وارد کند را لحظه‌ای تحمل نمی‌کنیم. هر اراجیفی که می‌خواستند، می‌گفتند!»